Исследование панели генов на базе полноэкзомного секвенирования методом NGS. Исследование проводится на оборудовании NextSeq 550Dx (РЗН 2021/13216).
В рамках исследования анализируется 103 гена, для которых, по актуальным научным данным, имеется убедительная информация о этиопатогенном значении для группы наследственных дисплазий соединительной ткани.
Дисплазии соединительной ткани (или недифференцированные дисплазии соединительной ткани) – это генетически детерминированные состояния, характеризующиеся дефектами волокнистых структур и основного вещества соединительной ткани, приводящие к нарушению формообразования органов и систем, имеющие прогредиентное течение, определяющие особенности ассоциированной патологии, а также фармакокинетики и фармакодинамики лекарственных средств (Российское научное медицинское общество терапевтов, 2018).
Внутри этой группы состояний отдельно выделяют наследственную форму дисплазий соединительной ткани. Наследственные нарушения (дисплазии) соединительной ткани – гетерогенная группа моногенных заболеваний, обусловленных генетическими дефектами. Чаще всего в данную группу относят такие болезни, как синдром Элерса-Данло, синдром Марфана, синдром Лоенца-Дитца, несовершенный остеогенез, эластолизис (cutis laxa), синдром Стиклера, синдром Уэйла-Маркенази.
Проявления недифференцированных дисплазий соединительной ткани в наибольшей степени определяются внешними факторами, в то время как клиническая картина наследственных нарушений соединительной ткани зависит от непосредственной генетической причины – от гена и генетического варианта в нем.
Ограничения исследования
Помимо общих технических ограничений метода NGS, следует учитывать ряд специфических особенностей данной панели, которые при отрицательном результате не позволяютполностью исключить все исследуемые патологии.
При кифосколиотическом типе синдрома Элерса-Данло (ген PLOD1) в ~30% случаев патогенные варианты представлены протяжёнными дупликациями нескольких экзонов, которые не детектируются в рамках используемой методики. Классикоподобный синдром Элерса-Данло 1 типа чаще всего ассоциирован с протяжёнными делециями гена TNXB, которые также не выявляются данным тестом.
Синдром Шерешевского-Тернера (кариотип 45, X0) характеризуется повышенным риском развития аневризмыаорты, однако его диагностика требует цитогенетического исследования.
Перечень исследуемых генов
ACTA2, ADAMTS10, ADAMTS17, ADAMTS2, ADAMTSL4, AEBP1, ALDH18A1, ATP6V0A2, ATP6V1A, ATP6V1E1, ATP7A, B3GALT6, B3GAT3, B4GALT7, BGN, BMP1, BRAF, C1R, C1S, CBS, CCDC134, CHST14, COL11A1, COL12A1, COL1A1, COL1A2, COL2A1, COL3A1, COL5A1, COL5A2, COL9A1, COL9A2, COL9A3, CREB3L1, CRTAP, DSE, EFEMP1, EFEMP2, ELN, FBLN5, FBN1, FBN2, FKBP10, FKBP14, FLNA, FOXE3, GAA, GATA5, GLA, IFITM5, KRAS, LOX, LTBP1, LTBP2, LTBP3, LTBP4, LZTR1, MAPK1, MBTPS2, MESD, MFAP5, MRAS, MYH11, MYLK, NOTCH1, NRAS, P3H1, PLOD1, PPIB, PPP1CB, PRDM5, PRKG1, PTPN11, PYCR1, RAF1, RIT1, ROBO4, RRAS2, SERPINF1, SERPINH1, SHOC2, SKI, SLC25A24, SLC2A10, SLC39A13, SMAD2, SMAD3, SMAD6, SOS1, SOS2, SP7, SPARC, SPRED2, TENT5A, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, THBS2, TMEM38B, TNXB, WNT1, ZNF469.